Zgodnie z przepisami ustawy o VAT za drugiego w kolejności podatnika uważa się tego, który dokonuje dostaw na rzecz ostatniego w kolejności podatnika VAT, którego siedziba działalności gospodarczej jest poza terytorium państwa członkowskiego, w którym kończy się wysyłka lub transport.
W przypadku wystąpienia transakcji trójstronnej uproszczonej, w której podatnik jest drugim w kolejności podatnikiem (rozpoznanie transakcji WNT) należy taką transakcję odpowiednio oznaczyć w nowym JPK_V7 symbolem TT_WNT.
Aby w programie Systim prawidłowo oznaczyć taką transakcje w pliku JPK_V7 należy w pierwszej kolejności ustawić odpowiedni parametr w Konfiguracji danych firmy. W tym celu w zakładce Księgi Handlowe lub KPiR > Konfiguracja> Dane firmy ustawiamy opcję możliwości wyboru rejestrów VAT jak poniżej.

Dalsza procedura wygląda następująco:
- Dla celów kosztowych wprowadzamy dokument zakupu jako zwykłą fakturę, ewentualnie fakturę walutową; nie wykazujemy VAT naliczonego z tytułu tej transakcji. Wprowadzamy ją tylko jako zapis do KH lub KPiR.
-Dla celów ewidencji JPK wprowadzamy dokument bezpośrednio do modułu KH lub KPIR poprzez kafelek Dodaj Zapis. Wybieramy dokument sprzedaży i odznaczmy możliwość zapisu do KH lub KPIR. Uzupełniamy dane typu data, kontrahent, nr dokumentu.
Następnie wybieramy odpowiedni rejestr VAT, czyli Rodzaj – "Zakup (VAT naliczony)" i Rejestr - "VAT należny - Wewnątrzwspólnotowe nabycie towarów".

W kolejnym kroku przechodzimy do zakładki JPK w edytowanym dokumencie i wybieramy odpowiednie oznaczenie dla celów deklaracji.
